刀使巫女世界，将自古以来威胁人世的异形存在·荒魂，以御刀拔除的神薙之巫女。
以制服佩刀为主要装束的她们，被称作“刀使”。
正式名称则是隶属**组织的特别祭祀机动队。
她们在身为得到佩刀许可的超法规*****的同时，还是在位于全国五处的中高一贯制训练学校就读的***。
故事**二十年前，相模*地区遭受了一场巨大的灾难。
为了应对这一危机，一支由折神紫、藤原美奈都、柊篝、羽岛江麻、高津雪娜、真庭沙南、相乐结月以及五条彩叶这八位精英组成的特别行动队应运而生。
他们肩负着讨伐大荒魂喘津姬的重任，毅然决然地踏上了征程。
在执行任务的过程中，不幸的是，高津雪娜身受重伤，生命垂危。
面对这一情况，折神紫深感责任重大，她不愿意看到更多的队友受到伤害。
于是，她果断地做出决定，让除了自己和藤原美奈都之外的其他队员护送雪娜前往安全地带接受治疗。
然而，事情的发展却出乎了所有人的意料。
在护送途中，藤原美奈都竟然悄悄地跟了上来，她心中的使命感让她无法割舍对任务的执着。
就这样，折神紫、藤原美奈都以及柊篝三人继续前行，与大荒魂喘津姬在山上展开了一场惊心动魄的激战。
战斗异常激烈，双方都使出了浑身解数。
最终，为了封印喘津姬，藤原美奈都和柊篝毅然决然地选择进入隐世，以自己的生命为代价，将喘津姬永远地封印在其中。
喘津姬眼见自己即将被封印，为了能够存活下来，她向折神紫提出了一个交易。
她愿意附身于折神紫身上，给予折神紫一定的时间来消灭自己。
但如果折神紫无法在规定时间内完成任务，那么她将彻底掌控折神紫的身体。
作为交换条件，喘津姬承诺会负责将藤原美奈都和柊篝两人带回现实世界。
折神紫为了友人的安全同意了喘津姬的条件。
最终喘津姬附身在折神紫身上。
喘津姬将藤原美奈都和柊簧两人带回来现实世界。
折神紫在确认两人还活着的世界时候，将藤原美奈都和柊簧两人带到安全的地方，宣布喘津姬己经被消灭。
在几年后折神紫成为了刀剑管理局局长，任命其他5名特务队的成员担任5校的校长。
藤原美奈都和柊簧两人先后生下来孩子，然后在孩子未长大前先后死亡。
2年前，折神紫妹妹折神朱音发现折神紫被大荒魂喘津姬附体了，于是暗中组建舞草，打算消灭大荒魂喘津姬。
时间回到现在，藤原美奈都和柊簧两人的女儿的卫藤可耐美和十条姬和两人刺杀折神紫失败，但是被大荒魂附身的折神紫故意放跑两人，打算利用两人找到舞草的大本营，将反对自己的舞草组织全部消灭，这样对喘津姬有两个好处。
第一可以解决反对自己的刀使们抓起来。
第二抓捕她们的过程中也必然要不少刀使抓捕她们，这样将没有多少刀使阻止自己复活。
但是折神朱音决定孤注一掷，她以自己为诱饵，吸引注意。
卫藤可耐美，十条姬和，系见沙耶香，柳濑舞衣，益子熏，古波藏爱莲6人组成敢死队，乘坐装备s装备的发射器，首接降落在折神家。
6人先是与折神紫的亲卫队西人**，打败她们后 ，然后6人与喘津姬**，但是不敌，最后卫藤可耐美通过模仿自己母亲的剑法，打了喘津姬一个措手不及，将喘津姬打伤，十条姬和用自己最后的力量施展出西段瞬移将喘津姬拉入隐世打算和喘津姬同归于尽。
但是卫藤可耐美使用瞬移打算把十条姬和救下来。
喘津姬为了活下去，也因为自己对这个世界的不同思想己经没办法共存，于是大荒魂的本体待在隐世。
三种思想分别化作三女神。
三女神分别是喘津姬，田心姬，市杵岛姬， 她们通过胜者吸收败者的方式决定胜利者，胜利者获得本体的控制权。
主要人物御刀和流派可**：新阴流（柳生新阴流），御刀千鸟姬和：新当流（鹿岛新当流），御刀小乌丸薰：药丸自显流，御刀祢祢切丸舞衣：北辰一刀流，御刀孙六兼元沙耶香：小野派一刀流，御刀妙法村正艾莲：太捨流，御刀越前康继紫：二天一流，御刀童子切安纲和大宝平包平真希：神道无念流，御刀薄绿寿寿花：鞍马流，御刀九字兼定夜见：深甚流，御刀水神切兼光结芽：天然理心流，御刀笑面青江喘津姬:二天一流，御刀太典丸和鬼珠丸田心姬: 新阴流，御刀太田丸市杵岛姬，一刀流，御刀，太岛丸本书设定十分强大的刀使可以放大招，御刀吸收附近的能量，释放出巨大的能量柱或是能量动物攻击对手。
刀使的其他通用能力写刀使的基本战术，也是最大的防御术。
以御刀为媒介，让**暂时变质为能量体。
利用“写”进行防御的期间，能够以些微的疼痛和精神疲劳为代价，让能量体负担对实体造成的伤害。
一旦受到伤害，相应的部分会消失，身体机能也会被夺取，但首到**“写”为止，都不会对实体造成任何伤害。
使用“写”的能力因人而异，普通刀使在被破“写”一次后就会失去战力，但也有伊南栖羽这种可以通过特训增加“写”的使用次数的存在。
迅移刀使的攻击术。
以御刀为媒介，从通常的时间中脱离并加速。
隐世中存在阶段性的时间高速流逝的层，越是潜入深处，就能够发动越高等级的迅移。
累积越多锻炼的人，就能够到达越深处的高速层。
共有五个阶段，刀使能到达的阶段数取决于自身能力，如十条姬和在动画第一话刺杀折神紫时使用的是三阶迅移，与卫藤可**将湍津姬推入隐世时两人的迅移都是五阶。
